Троллейбусный маршрут № 1. Монумент Дружбы - Северный автовокзал
Троллейбусный маршрут № 2. Колхозный рынок - Башгосакадемдрамтеатр
Троллейбусный маршрут № 3. Центральный рынок - КПМ
Троллейбусный маршрут № 4. Северный автовокзал - Троллейбусное депо 2
Троллейбусный маршрут № 5. Северный автовокзал - Кольцевая - Вологодская
Троллейбусный маршрут № 6. улица Аральская - Трамплин
Троллейбусный маршрут № 7. Телецентр - Трамплин
Троллейбусный маршрут № 8. Троллейбусное депо 2 - Трамплин
Троллейбусный маршрут № 9. ТЭЦ-1 - Перовмайская - ДОК (изменен в 2003 году)
Троллейбусный маршрут № 10. ТЭЦ-1 - Кольцевая - ДОК (изменен в 2003 году)
Троллейбусный маршрут № 11. Северный автовокзал - Ледовый дворец "Уфа-Арена" (изменен с 24.12.2006)
Троллейбусный маршрут № 12. Башгосакадемдрамтеатр - Микрорайон Белореченский
Троллейбусный маршрут № 13. Бульвар Славы - Микрорайон Белореченский (изменен 04.06.2006)
Троллейбусный маршрут № 14. Колхозный рынок - Микрорайон Белореченский
Троллейбусный маршрут № 15. ДОК - ДК Машиностроителей (открыт в феврале 2006)
Троллейбусный маршрут № 16. Театр кукол - Микрорайон Белореченский
Троллейбусный маршрут № 17. Колхозный рынок - АБЗ
Троллейбусный маршрут № 18. Центральный рынок - поселок 8 Марта
Троллейбусный маршрут № 19. улица Королева - Телецентр
Троллейбусный маршрут № 20. ДЮЦ "Салям" - Микрорайон Белореченский (открыт 9.10.2001 года)
Троллейбусный маршрут № 21. Центральный рынок - Микрорайон Белореченский (открыт 11.10.2006)
Троллейбусный маршрут № 22. Бульвар Славы - Ледовый дворец "Уфа-Арена" (открыт 24.12.2006)
